Bei einer Nahrungsmittelunverträglichkeit bzw. Nahrungsmittelintoleranz ist das körpereigene Abwehrsystem nicht beteiligt. Es handelt sich um eine nicht-immunologische Reaktion, bei der der Körper Schwierigkeiten hat, bestimmte Nahrungsmittel abzubauen oder zu tolerieren. Es fehlen eine ausreichende Menge an bestimmten Enzymen oder Transportproteinen, um bestimmte Bestandteile der Nahrung, wie z.B. Laktose, Fruktose oder Histamin abzubauen. Die Symptome einer Nahrungsmittelunverträglichkeit können Verdauungsbeschwerden wie Bauchschmerzen, Blähungen, Durchfall oder Übelkeit umfassen.